23 मई 1999 को, सेनाध्यक्ष जनरल वेद मलिक, पीवीएसएम, एवीएसएम (सेवानिवृत्त) और नौसेनाध्यक्ष एडमिरल सुशील कुमार, पीवीएसएम, यूवाईएसएम, एवीएसएम, एनएम (सेवानिवृत्त) के बीच एक बैठक में दोनों प्रमुख सभी परिसंपत्तियों के इष्टतम उपयोग के बड़े लाभ के लिए कारगिल में संचालन के लिए एक संयुक्त सेवा योजना दृष्टिकोण अपनाने पर सहमत हुए। तदनुसार युद्ध को बलों के तीनों अंगों के बीच विस्तृत समन्वय के साथ एकीकृत तरीके से लड़ा जाना था। इसका बल गुणक प्रभाव पड़ा। जनरल वेद मलिक, पीवीएसएम, एवीएसएम (सेवानिवृत्त) अपनी पुस्तक कारगिल: सरप्राइज टू विक्ट्री में लिखते हैं, "भारतीय नौसेना ने सीसीएस बैठक से पहले अलर्ट के लिए निर्देश जारी किए थे और द्वारका (गुजरात में) के तट पर एक बैरियर गश्त पर आईएनएस तारागिरी को तैनात किया था ऑपरेशन रूम में सीसीएस की बैठक 25 मई 2023 को हुई। 26 मई, 1999 को कारगिल में भारतीय हवाई हमले शुरू हुए। वायुसेना और नौसेना के युद्ध में शामिल होने के बाद, घुसपैठियों को बाहर निकालने के लिए भारतीय सेना का दृढ़ संकल्प पाकिस्तान के सामने बहुत स्पष्ट हो गया।

भारतीय नौसेना द्वारा कराची बंदरगाह को बंद करने के लिए द्वारका के तट पर बैरियर गश्त पर जहाजों को तैनात करके ऑपरेशन तलवार की शुरुआत की गई, जबकि पश्चिमी बेड़े के संसाधनों के पूरक के लिए पूर्वी बेड़े के तत्वों को भेजा गया।

गुप्त पानी के नीचे के हमलों से अपतटीय सुरक्षा सुनिश्चित करने और सभी समुद्री हितधारकों के प्रयासों को एकीकृत करने के उद्देश्य से एक महत्वपूर्ण कदम में पश्चिमी नौसेना कमान ने 22 मई 1999 को मुंबई से जहाजों को रवाना किया। 25 मई तक, निगरानी बढ़ाने और निवारक रुख अपनाने के लिए एहतियाती तैनाती के तौर पर पूरा पश्चिमी बेड़ा मुंबई से उत्तरी अरब सागर की ओर रवाना हो गया था। 27 मई तक, नौसेना ने सौराष्ट्र के पास एक निर्देशित मिसाइल विध्वंसक तैनात किया था और निगरानी बढ़ाने के लिए दमन में अतिरिक्त डोर्नियर विमान तैनात किए थे। प्रवीर पुरोहित ने इंडियन एक्सप्रेस में अपने लेख ‘कारगिल विजय दिवस: कैसे भारतीय नौसेना के ऑपरेशन तलवार ने पाकिस्तान को अरब सागर से बाहर निकाला’ में लिखा है, ऑपरेशन तलवार में तटीय सुरक्षा को मजबूत करने और तटरक्षक, सीमा शुल्क और पुलिस जैसी एजेंसियों के साथ मिलकर समुद्री गश्त करने जैसी सुरक्षात्मक गतिविधियाँ शामिल थीं। पूरी तरह से हथियारों से लैस जहाज, पनडुब्बी और विमान जैसे युद्धक उपकरण तैनात किए गए थे। ऐसा नहीं था कि नौसेना के ऑपरेशन और गतिविधियाँ समुद्री क्षेत्र तक ही सीमित थीं। एडमिरल सुशील कुमार पीवीएसएम, यूवाईएसएम, एवीएसएम, एनएम (सेवानिवृत्त) के अनुसार, नौसेना के विशेष रूप से सुसज्जित इलेक्ट्रॉनिक युद्धक विमानों के स्क्वाड्रन ने भूमि संचालन के समर्थन में नियंत्रण रेखा पर बड़े पैमाने पर काम किया। भारतीय नौसेना की विशेषज्ञ हाइड्रोग्राफिक सर्वेक्षण टीमों को सेना की तोपखाना बैटरियों के साथ जोड़ा गया ताकि तोपों के स्थानों को चिन्हित किया जा सके। आईएनएस हंसा कारगिल युद्ध के दौरान अपने नौसेना वायु तत्वों के साथ सक्रिय रूप से शामिल था।

जून की शुरुआत में, पूर्वी बेड़े की इकाइयों के युद्ध के लिए तैयार जहाज पश्चिमी बेड़े में शामिल हो गए। हालांकि पश्चिमी नौसेना बेड़ा पाकिस्तानी नौसेना से निपटने के लिए पर्याप्त था और बल अनुपात भारत के पक्ष में सात-से-एक था - पूर्वी नौसेना बेड़े को पश्चिम की ओर मोड़ दिया गया और भारत की सामरिक अपतटीय संपत्तियों के लिए पाकिस्तान द्वारा किसी भी समुद्री खतरे से निपटने के लिए कमांडर-इन-चीफ पश्चिमी कमान के समग्र नियंत्रण में रखा गया।

पूर्वी नौसेना कमान के जहाजों को उत्तरी अरब सागर में पश्चिमी नौसेना कमान के बेड़े में शामिल होने के लिए भेजकर, भारतीय नौसेना ने पाकिस्तानी बंदरगाहों, मुख्य रूप से कराची को अवरुद्ध कर दिया, आपूर्ति मार्गों को काट दिया और आक्रामक गश्त शुरू कर दी और पाकिस्तान के समुद्री व्यापार को काटने की धमकी दी। इसने समुद्र आधारित तेल और व्यापार प्रवाह पर पाकिस्तान की निर्भरता का फायदा उठाया। मेजर जनरल अशोक मेहता (सेवानिवृत्त) लिखते हैं, परिचालन की दृष्टि से, पूर्वी नौसेना बेड़े को खाड़ी से अपने बंदरगाहों तक पाकिस्तानी शिपिंग लेन को कवर करने के लिए तैनात किया गया था। पाकिस्तानी नौसेना ने अपने समुद्री विमान उड़ाए और एक बार जब तैनाती का पैमाना और विस्तार समझ में आ गया, तो यह रक्षात्मक मोड में चला गया, अपने जहाजों को भारतीय नौसेना से दूर रहने की चेतावनी दी।

पूर्वी नौसेना कमान के जहाजों को पश्चिमी नौसेना कमान के बेड़े में शामिल करने से भी तैनाती की सीमा का विस्तार करने में मदद मिली। नौसेना के कर्मचारियों ने पाकिस्तान की तेल भेद्यता और पाकिस्तानी टैंकरों को रोकने की योजनाओं का विश्लेषण किया। ‘पहुंच और गतिशीलता’ के नौसेना प्रक्षेपण का तत्काल प्रभाव पड़ा: पाकिस्तान नौसेना के जहाजों ने फारस की खाड़ी से तेल लाने वाले टैंकरों की सुरक्षा शुरू कर दी। जून के दूसरे सप्ताह तक, संयुक्त पश्चिमी और पूर्वी बेड़े ने एक व्यापक संघर्ष के लिए नौसेना की तत्परता की जांच करने के लिए अभ्यास शुरू कर दिया। वाइस एडमिरल जीएम हीरानंदानी, पीवीएसएम, एवीएसएम, एनएम (सेवानिवृत्त) के अनुसार, पाकिस्तानी नौसेना ने अपने जहाजों को कराची से दूर मकरान तट पर अपने बंदरगाहों - ओरमारा, पसनी, ग्वादर और जिवानी में भेज दिया।

दो सप्ताह बाद, जब पाकिस्तान ने भारत को परमाणु हमले की धमकी देने वाले परमाणु हथियार ले जाने में सक्षम मिसाइलों की तैनाती की घोषणा की, तो भारतीय मिसाइल सशस्त्र जहाजों ने पाकिस्तान तट के करीब जाकर जवाब दिया। पाकिस्तान को दिया जाने वाला संदेश

जल्द ही पाकिस्तानी घुसपैठिए अपने बंकरों को खाली करने लगे और 04 जुलाई 1999 तक पाकिस्तान प्राधिकार ने बिना शर्त वापसी की घोषणा कर दी। 14 जुलाई 1999 को प्रधान मंत्री श्री अटल बिहारी वाजपेयी ने ऑपरेशन तलवार को सफल घोषित किया। अपने कौशल का कुशल प्रदर्शन करते हुए नौसेना ने संघर्ष में भारत को रणनीतिक बढ़त दिलाने में महत्वपूर्ण भूमिका निभाई। पाकिस्तानी नौसेना ने अपनी इकाइयों को भारतीय नौसेना के जहाजों से दूर रहने की चेतावनी देकर प्रतिक्रिया व्यक्त की। इसके बाद भारतीय नौसेना पूरी तरह सतर्क रही और “आक्रामक” से “आक्रामक रक्षा” की मुद्रा में आ गई। कारगिल समिति की रिपोर्ट में उल्लेख किया गया है कि भारतीय नौसेना ने मकरान तट पर इकाइयों को तैनात करके मनोवैज्ञानिक अभियानों का भी सहारा लिया, इस प्रकार, जबकि भारतीय नौसेना का प्रयास कारगिल संघर्ष को बढ़ने से रोकने के राष्ट्रीय प्रयास के अनुरूप था, समुद्री मोर्चे पर कड़ी निगरानी रखकर समुद्र में उच्च स्तर की रोकथाम बनाए रखी गई।

कमोडोर श्रीकांत केसनूर और कमांडर दिग्विजयसिंह सोधा ने सही उल्लेख किया कि ऑपरेशन तलवार भारतीय नौसेना के इरादे और क्षमता का प्रदर्शन था। नौसेना बल के सभी तत्वों को कार्रवाई में लगाया गया था, पहला, पाकिस्तानी नौसेना की संपत्तियों की स्थिति का पता लगाने के लिए और दूसरा, यह सुनिश्चित करने के लिए कि समुद्र में भारत की उच्च मूल्य की संपत्ति, बॉम्बे हाई, साथ ही तटीय क्षेत्रों, विशेष रूप से गुजरात में, अच्छी तरह से संरक्षित है। विचार यह था कि पाकिस्तान को सफलता का दावा करने का कोई अवसर न दिया जाए और यह सुनिश्चित किया जाए कि यदि पाकिस्तान सीमित कारगिल क्षेत्र से युद्ध का विस्तार करने की हिम्मत करता है, तो नौसेना दक्षिण में एक और मोर्चा खोल देगी। इस ऑपरेशन में अरब सागर में लड़ाकू जहाजों की अब तक की सबसे बड़ी तैनाती शामिल थी। जैसे-जैसे भारत ने अपने नौसैनिक विमानन, पनडुब्बी, उभयचर और तटरक्षक संपत्तियों को क्रमिक रूप से शामिल किया और इलेक्ट्रॉनिक युद्ध अभ्यास सहित उच्च गति के ऑपरेशन किए, संकेत स्पष्ट था। इसके अलावा, जब पाकिस्तानी अधिकारियों ने 'एन' शब्द के बारे में बात करना शुरू किया, तो भारत ने जवाब में अपने जहाजों को पाकिस्तान तट के करीब ले जाकर स्पष्ट संकेत दिया कि हम परमाणु ब्लैकमेल के आगे नहीं झुकेंगे।

ऐसा नहीं था कि भारतीय नौसेना के युद्धपोत पाकिस्तानी नौसेना के खतरों के प्रति संवेदनशील नहीं थे। भारतीय युद्धपोत पाकिस्तानी नौसेना की घातक हार्पून एक्सोसेट सी-स्किमिंग मिसाइलों के खिलाफ एंटी-मिसाइल डिफेंस (एएमडी) के बिना असुरक्षित थे। यह एक गंभीर कमजोरी थी, लेकिन पश्चिमी नौसेना कमान के फ्लैग ऑफिसर कमांडिंग इन-चीफ, वाइस एडमिरल माधवेंद्र सिंह और नौसेना स्टाफ के प्रमुख एडमिरल सुशील कुमार ने स्थिति का जायजा लिया था।

ऑपरेशन विजय (कारगिल ऑपरेशन) के दौरान भारतीय नौसेना का अनुभव, तनाव को कम करने और नियंत्रण में मजबूत समुद्री बलों की उपयोगिता का प्रमाण है। उत्तरी अरब सागर में भारतीय नौसेना की स्थिति ने भारत के परिचालन लक्ष्यों की प्रारंभिक उपलब्धि और, सबसे महत्वपूर्ण रूप से, संघर्ष के दायरे को सीमित करने में महत्वपूर्ण योगदान दिया। जैसा कि एडमिरल सुशील कुमार ने कहा, "हमारी नौसेना की जबरदस्त श्रेष्ठता का पाकिस्तान पर गंभीर प्रभाव पड़ा।" भारतीय नौसेना ने संघर्ष को कारगिल के पहाड़ी क्षेत्र तक सीमित रखने में महत्वपूर्ण भूमिका निभाई थी और उत्तरी अरब सागर में इसकी स्थिति ने भारत के परिचालन लक्ष्यों की शीघ्र प्राप्ति में महत्वपूर्ण योगदान दिया।